众所周知,前列腺癌有时候是由于各种原因加剧的遗传基因组病所加剧,但哪些基因组在前列腺癌之中鲜少愈演愈烈性状呢?你或许意想不到,这个基因组问题在前列腺癌基因组组学短时间内的发展的那时候,仍然不会得到解答。
已对,American马里兰州大学和索尔克分析所的分析医护人员在 Nature Commnications 刊物发表了一本书:Cancer gene mutation frequencies for the U.S. population 的分析论文。
这篇论文讲出了一个并不基本的问题:人类前列腺癌之中鲜少见的性状基因组是什么?
分析团队将遗传基因组病信息与前列腺癌患病率信息相联结,阐释了整个American前列腺癌病变人群之中前列腺癌的遗传基因组根基。这项工作阐释了每个基因组在前列腺癌病变群体之中愈演愈烈性状的阈值,这些发掘出可以帮助指导研发更合理的前列腺癌放射治疗方法。
遗传基因组病在前列腺癌的愈演愈烈和的发展之中发挥着至关重要的作用,而且这些性状的基因组也可以作为合理的放射治疗贝克曼。
虽然许多分析那时候确认了某些前列腺癌之中涉及的遗传基因组病,但还不会分析系统阐释哪些遗传基因组病在整个前列腺癌病变群体之中甚为罕见。
在这项新分析之中,分析团队联结了基因组组学和流行病学前列腺癌分析的信息集,以确认所有前列腺癌病变;还有多少百分比会愈演愈烈何种遗传基因组病。
原本,分析团队认为这项工作似乎很简单,然而他们开始后立刻就发掘出了难题所在:基因组组学和流行病学分析并未对各种前列腺癌用于标准化名字系统。例如,一些分析医护人员根据身体部位对前列腺癌顺利完成分类学,而另一些分析医护人员则根据多种类型对前列腺癌顺利完成分组,还有许多分析医护人员将两者联结用于。这使得信息整理变得困难。
为了克服这一挑战,分析团队仔细分析了200多项分析,并根据标准化名字系统对每种前列腺癌顺利完成了单独初审和重新分类学,然后再顺利完成信息对比和加权。
分析团队统计发掘出,前列腺癌之中鲜少见的遗传基因组病是TP53(34.5%),其次是PIK3CA(13.5%),LRP1B(13.1%),令人意外的是,只有11%的前列腺癌愈演愈烈了KRAS遗传基因组病,这远低于之前认为的25%。排在前十位的还有APC、FAT4、KMT2D、KMT2C、BRAF。
前列腺癌之中鲜少见的性状基因组TOP50
前列腺癌之中鲜少见的性状基因组TOP25的具体信息
这是首次在所有前列腺癌之中评估遗传基因组病的阈值和数量,这些结果提醒了我们所需重新评估不应将时间、精力和资源密集到哪些应用,这些发掘出可以帮助指导研发更合理的前列腺癌放射治疗方法。
原始应是:
Mendiratta, G., Ke, E., Aziz, M. et al. Cancer gene mutation frequencies for the U.S. population. Nat Commun 12, 5961 (2021). https://doi.org/10.1038/s41467-021-26213-y.
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